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手把手教学
2024-12-05

我强烈建议各位需要接触Western blot实验的同学认真阅读本文章,或收藏起来。这篇文章真正做到了一步一步的手把手实验教学讲解,每一步做什么、怎么做、要注意什么都写的非常详细,配上图例和常见问题解析,可以说就算0基础的同学,看完后也能动手开始做实验了。文章作者是“旺旺仙贝”同学,为她点赞!

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实验老司机

一、原理

蛋白质免疫印迹法即Western Blot。

它是分子生物学、生物化学和免疫遗传学中常用的一种实验方法,基本原理是经过 PAGE(聚丙烯酰胺凝胶电泳)分离的蛋白质样品,转移到固相载体例如硝酸纤维素薄膜(NC膜)或PVDF膜上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。

以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。

二、流程图:

(一)蛋白上清液提取:

a、准备工作:分装需要体积的蛋白裂解液(IP/RIPA),再分别加蛋白酶抑制剂(蛋白裂解液:PMSF 体积比为100:1),磷酸化蛋白酶抑制剂(蛋白裂解液:磷酸化蛋白酶抑制剂体积比为100:2)于蛋白裂解液中,加入Aprotinin 蛋白酶抑制剂,蛋白裂解液:Aprotinin(500×)体积比为 100:0.2;

b、剪取适量组织(尽量保证每一粒样品都剪去的一样多)和适量混匀的蛋白裂解液于匀浆器中磨匀(0.01g组织加上50-100ul的蛋白裂解液),直至看不见组织块;

c、转移匀浆液于 1.5ml 离心管中,置于冰上蛋白裂解10min;

d、提前开离心机预冷,4℃,12000rpm 离心 15min ;

e、将离心后的上清分装转移倒 1.5ml 新的离心管中,部分用于实验多余的存于-20℃;

若实验对象为细胞:悬浮细胞、贴壁细胞

悬浮细胞:

①收细胞:细胞悬液收集到离心管中,5000rpm,去上清,加1mlPBS,5000rpm,5min,加50ulIP/RIPA裂解液,冰上裂解20-30min;

②打蛋白:超声仪,探头使用前用纯水清洗,探头伸入液面以下,避免太多;设置程序:(打3s,停3s,共计92次);破碎细胞后,4℃,12000rpm,10min离心,取上清(蛋白),蛋白置于冰上或放置-80℃。

注意:

①贴壁细胞:先用PBS缓冲液清洗两遍,然后加入蛋白裂解液(IP/RIPA),然后用细胞刮板将细胞 蛋白裂解液移至离心管中。

②一管细胞打20次左右,打蛋白的过程中会发热,可暂停置于冰上数秒。

BCA测蛋白浓度:(通常利用BCA试剂盒测定),基本流程如下:

96孔板:(一般最外围的孔不利用或加等体积的PBS溶液防止污染和蒸发)

(1)蛋白标准品BSA做标曲,取7个EP管,编号①-⑦

(2)浓度:①2、②1、③0.5、④0.25、⑤0.125、⑥0.0625、⑦0(单位:mg/ml)

(3)②-⑦ 50ulPBS,①-② 50ulBSA

(4)②混匀,取50ul加③,依次加到⑥

(5)配样品浓度:45ulPBS 5ul样品浓度,配完短暂离心混匀(计算浓度时×10)

(6)配制工作液,配完避光,现配现用(A液:B液=50:1,一个孔要200ul工作液):一个样要2个重复孔,计算体系:7个标准品 1个待测液溶液×2,共计16孔;防止加样误差,配置20个体系,一个200ul(20×200=4000ul/4ml)

(7)加样到96孔板:一个孔:20ul蛋白溶液 200ulBCA工作液;标准品从⑦-①加,两个平行孔一起加。

(8)37℃孵育30min(孔板底部勿触碰,保持完全干净)

  1. 测562nm处OD值,制作标准曲线(excel)

图1 37℃恒温箱孵育后,下一步酶标仪测定OD值
2、蛋白液变性
a 将上步蛋白上清液与 5×loading buffer 4:1 混匀,
b 在沸水中煮 5min,水浴结束后,常温离心(瞬离),制胶后用于上样。
(二) 配胶
1、制胶:浓缩胶/上层(5%);分离胶/下层(根据蛋白分子大小而定)
(1)制胶前用纯水检漏,加入纯水放置2-3min;
2)配制下层胶:试剂盒配置好的胶液靠边注入玻璃板(尽量不要产生气泡);加入无水乙醇/双蒸水压平胶面,静置等胶凝固(根据天气室温变化,一般30min以上);配制上层胶:下层胶凝固后倒掉无水乙醇/双蒸水,滤纸吸干,上层胶缓缓注入,插梳子,等待凝固(约1h)
图2 制胶完成后
分离胶范围:

(三)电泳
1、配制上样体系:蛋白溶液 5×loading buffer PBS
     蛋白上样量:20-50ug
2、上样:最左和最右孔可加SDS-PAGE loading buffer压平条带;可与最中央或左右两端各加入3-5ul的蛋白maker;蛋白样品上样(9ul)
图3、4 上样,80v电压
图5 蛋白maker分离
3、将胶置于电泳槽中,倒入电泳缓冲液,内部要漫过矮板,外部要漫过玻璃板底部;
4、准备样品 maker 于冰盒上,顺序排好,上样,并在实验本上记录好;
5、盖上电源盖,正负极相互对应,接通电源,恒压浓缩胶80V,30min或maker分离后可更改电压为120v,跑分离胶。待 loading buffer中的溴酚蓝跑至脚底部 1cm 处停止电泳。整个时间大概为 1.5h-2h。
(四) 转膜
1、根据 maker 的指示,分别切出对应需要分子量蛋白的胶;并用尺子量取胶的宽度;
2、准备6张与胶同样大小的滤纸和1张NC膜一起放入转膜缓冲液中,至完全浸透。使用PVDF膜需要用甲醇激活。
3、按照3张滤纸,膜,胶,3张滤纸的顺序依次放好,要求中间没有气泡。将电泳夹轻轻夹紧,放入电泳仪中,要求胶靠近负极(电泳仪中的黑色一面)膜 靠近正极(电泳仪中红色一面),倒入电泳缓冲液没过有胶的地方。
4、盖上电源盖,接通电源,转膜,不同的分子量转膜时间不同;(例如300mA,1h,20-25KD)
注意:
①黑面朝上,组装结构为:(黑)海绵—滤纸(2-3张)—胶—膜—滤纸(2-3张滤纸)—海绵(红or白)。如下图:
图6 “三明治”组装顺序
②转模槽需埋入冰中,防止转膜过程中甲醇产热温度过高。
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