分析人士认为，作为以色列的“眼中钉、肉中刺”，伊朗的核设施毫无疑问是以军首要实施打击的重点目标。实际上，以色列不止一次希望将40多个与伊朗核计划相关的建筑物“从地球上彻底抹去”，然而对于内塔尼亚胡当局来说，袭击行动存在巨大技术和地缘政治困境。
（以色列空军F-35I战斗机）
从纯军事角度上来讲，此前10多年时间里，以色列空军不止一次想通过大规模越境空袭，来“彻底终结”伊朗的核计划，但袭击伊朗的核设施远比袭击伊拉克的核目标更加复杂。种种迹象表明，以色列迟迟没有将自己的军事报复付诸实施，可能是在等待时机，解决越境外交协议问题，因为“打击航线”始终是干扰以色列空袭的核心因素。
以色列空军的军用机场距离伊朗核计划目标至少需要飞行1500公里，而且不管选择什么飞行线路，这都需要飞越约旦、叙利亚、沙特、土耳其和伊拉克等国领空，才能抵达伊朗空域，这就涉及到非常复杂的外交问题。
（以色列空军）
据美国媒体披露，以色列空军自2015年以来就设定了三条打击线路：
第一航线，以军会将作战飞机从以色列北部空军基地集结，机群起飞后，首先穿越土耳其南部和叙利亚交界地区空域，途径美军控制的伊拉克北部摩苏尔地区，在进入伊朗境内后，打击编队将分为三个打击小组，分头对德黑兰周边地区的伊朗核设施实施空袭。这条航路的主要障碍是如何获得土耳其方面的越境许可，通常情况下，如果美国直接介入其中，那么土耳其将不大可能允许以色列穿越其领空。
第二航线，主要将以色列空军作战编队分为两组，第一组从约旦进入沙特北部的沙漠无人机区，然后从伊拉克中部空域直插伊朗东部地区，另一组则在伊拉克南部地区转向，对位于伊朗南部沿海的布什尔轻水反应堆实施轰炸。
（以色列空军和美军）
这一打击航线的飞行距离最短，打击行动的单程距离仅为1350至1500公里。主要障碍是必须采用远程低空飞行方式，秘密通过相关国家空域，此外还必须使用电子战手段，才能避免被这两个国家的防空系统发现。
第三航线，是将打击部队集中在以色列南部机场，然后飞越约旦、沙特和波斯湾上空，这条航线单程超过1700公里，对于伊朗的地面防空系统来说，属于“出乎意料”的致命一击。然而，鉴于沙特和伊朗早已经握手言和，以色列不可能在短时间内得到沙特政府的直接支持，除非以军对沙特境内的防空网络实施电子战压制，否则以军的轻举妄动都将引发巨大的外交风波。
（伊朗防空导弹）
值得注意的是，以军F-35I战斗机在载弹情况下的作战半径大约为1000公里左右，而以色列空军的F-16I战斗机约为1400公里，F-15I战斗机约为1900公里，即便以色列军队在伊朗空域内没有遭遇该国战斗机的追击，以色列空军也不可能在不进行空中加油的情况下，对伊朗实施空袭。
对此，以色列空军的备用方案，要么是战斗机起飞后在约旦和沙特空域进行空中加油，要么是在约旦空中加油后完成轰炸后任务，然后让战斗机在格鲁吉亚机场降落。
无论选择上述哪一条，以色列空军都将需要组织一个大型航空战役编队，这其中包括电子战飞机、预警指挥飞机、战斗机和无人机等，如此大规模的空中战役，将考验以色列空军的战役指挥和空中协同作战能力，也考验以色列的综合电子战能力。
（伊朗防空导弹）
分析人士指出，除去航路选择和作战半径问题，伊朗的防空能力也将成为以色列组织反击的障碍之一。作为中东地区的军事强国，伊朗拥有一支总体作战能力较为强大的武装力量。
不过，伊朗的防空指挥体系十分复杂，一方面该国的防空部队由伊朗国防军下属的防空军以及伊朗革命卫队空天军下属的防空部队组成，另一方面，这些防空力量各自为政，都拥有得力的指挥体系。而且，与伊朗防空军形成鲜明对比的是，伊朗革命卫队下属的防空部队缺乏远程防空系统，更多属于陆军军事行动的伴随防空火力，或者在要地防空中执行末端拦截任务。
（伊朗防空导弹）
总体上来说，虽然伊朗防空部队在近年来得到了长足进步，但是面对武装到牙齿的以色列空军，伊朗防空系统还存在诸多问题。首先，伊朗防空军装备的远程防空系统等骨干装备均来自进口，这其中伊朗防空军的S-300PUM2导弹因为数量有限，只能在各个核设施之间来回布防，一旦以色列军队决定实施空袭，伊朗的防空系统将处于疲于奔命的状态。
其次，尽管伊朗建立了较为复杂的中远程和超远程雷达监视体系，但是伊朗仍旧缺乏航天遥感、天基雷达和空中预警机为代表的先进监视手段。与此同时，伊朗防空力量还急需建立覆盖全国的现代化、集约化和信息化的统一防空预警体系，各自为政的要地防空必然会被以色列各个击破。
（以色列空军）
然而，受到技术、资金和本国特殊地形条件的限制约束，伊朗革命卫队和伊朗防空军的低空和超低空探测能力十分薄弱，对于低空飞行的隐身目标和巡航导弹的侦测更是漏洞百出，由于低空补盲雷达分布不合理，要想防范敌方隐身战机、巡航导弹和无人攻击机低空突袭，伊朗防空部队要做的事情还很多。与此同时，伊朗还缺乏对隐身目标的探测跟踪能力，缺乏反隐身战力将导致其对以军F-35I战斗机的防御很可能形同虚设。